特聘副研究员-胡海洋

发布日期:2017-11-30浏览次数:10

胡海洋,生物信息学博士,2017年以特聘副研究员引进,目前为生命科学与技术学院硕士生导师。2008年毕业于华中科技大学,获得生物化学与分子生物学硕士学位,之后在德国马普克分子遗传所所长Martin Vingron教授课题组以及德国马普人类进化学研究所研究员Philipp Khaitovich 教授课题组进行博士阶段学习,2016年毕业于德国柏林自由大学,获得生物信息学博士学位。2016年到2017年在中国科学院德国马普计算生物学研究所任助理研究员。研究工作主要依托于高通量测序数据,结合序列特征分析,采用计算调控基因组学与进化生物学相结合的研究方式,聚焦于非编码RNA的识别、进化机制以及功能调控机理研究。目前共发表SCI论文16篇,5年引用数超1000次,其中第一作者及通讯作者文章8篇,主要发表在Nature Communications, Nature ecology & evolution, PLoS Genetics以及Nucleic Acids Research等国际知名学术期刊。

  

研究方向:

1.转录组变异在器官发育、固有免疫以及疾病发生发展过程中的系统生物学研究

2.非编码RNA的起源进化机制与功能调控研究

3.加速进化非编码RNA与人类疾病的关联研究

  

5篇代表性论文:

1Hu HY#, Uesaka, M#., Guo, S#., Shimai, K., Lu, T.M., Li, F., Fujimoto, S., Ishikawa, M., Liu, S., Sasagawa, Y., Zhang, G., Kuratani, S., Yu, J.K., Kusakabe, T.G., Khaitovich, P., Irie, N*. and Consortium, E, (2017) Constrained vertebrate evolution by pleiotropic genes. Nature ecology & evolution, 1, 1722-1730.

2Hu HY*, He L, Khaitovich P*, Deep sequencing reveals a novel class of bidirectional promoters associated with neuronal genes. BMC Genomics 2014, 15:457.

3Hu HY#, He L#, Fominykh K, Yan Z, Guo S, Zhang X, Taylor MS, Tang L, Li J, Liu J, Wang W, Yu H*, Khaitovich P*, Evolution of the human-specific microRNA miR-941. Nat Commun 2012, 3:1145.

4Hu HY#, Guo S#, Jiang X, Yan Z, Fu N, Zhang X, Menzel C, Liang H, Yang H, Zhao M, Zeng R, Chen W, Pääbo S, Khaitovich P*, MicroRNA Expression and Regulation in Human, Chimpanzee, and Macaque Brains. Plos Genetics 2011, 7.

   (5)   Yan Z#,Hu HY#, Jiang X, Maierhofer V, Neb E, He L, Hu YH, Hu H, Li N, Chen W, Khaitovich P*, Widespread expression of piRNA-like molecules in somatic tissues. Nucleic Acids Research 2011, 39:6596-6607.